萌学园之圣战再起全集讲述的是事从传说中的夸克族与暗黑族开始延伸。善良与邪恶形成两势力对抗，加入「萌学园」里的萌骑士团结在一起保护结界。萌学园里的魔法预言书蕴藏著什?天大的秘密？奈亚公主及忧伤艾瑞克纯纯的情愫正在发酵，误闯…